El Departament de Bioenginyeria es va fundar l'any 2007 per agrupació de diferents laboratoris de l'IQS en l'àmbit de les Ciències de la Vida i per la incorporació de nous grups de recerca. Formen el Departament cinc laboratoris: Bioquímica, Biomaterials, Microbiologia, Bioprocessos i Enginyeria de Teixits. Les seves àrees d'activitat combinen diferents aproximacions d'investigació bàsica i aplicada a la biomedicina, biotecnologia industrial, i biotecnologia alimentària i mediambiental.
El Departament s'encarrega de la docència de les matèries biològiques i bioquímiques en el Grau en Química i en el Grau en Enginyeria Química. Coordina i imparteix el Màster en Bioenginyeria i el Programa de Doctorat en Bioenginyeria. També col·labora en el Màster en Química i Enginyeria Alimentària i en el Màster de Recerca en Química i Enginyeria.
Les línies de recerca s'emmarquen dins de les Àrees de Ciències de la Vida, Química i Enginyeria de Processos i Bioprocessos, i Materials i Biomaterials.
Laboratori de Bioquímica
Enginyeria de proteïnes i enzimologia de glicosidases i glicosiltransferases
Dianes terapèutiques en enfermetats infeccioses
Proteïnes amiloides en enfermetats neuro-regeneratives
Biocatàlisi: redisseny enzimàtic, evolució dirigida d'enzims, i enginyeria metabòlica
Enginyeria metabòlica per a la producció de glicoglicerolípids
Laboratori de Biomaterials
Nanopartícules polimèriques sensibles a un estímul per l'alliberament controlat de fàrmacs
Disseny de superfícies biomimètiques amb senyalització cel·lular química i mecànica. Smart surfaces
Disseny i fabricació de scaffolds per a la regeneració de teixit ossi i cartilaginós
Laboratori de Microbiologia
Micotoxines i floridures productores
Aspectos microbiològics de la teràpia fotodinàmica
Seguretat alimentària i mediambiental
Laboratori de Bioprocessos
Expressió de proteïnes recombinants i metabolits, millora i optimització de bioprocessos i biorreactors.
Utilització de subproductes industrials per la obtenció de productes biotecnològics d'alt valor afegit
Aïllament de productes per processos de bioseparació.
Laboratori d'Enginyeria de Teixits
Disseny i síntesi de biomaterials nanomètrics anàlegs a matrius extracel·lulars
Desenvolupament d'ambients tridimensionals instructius per diferenciació funcional de cèl·lules mares
Reprogramació ambiental de cèl·lules adultes per el seu ús a plataformes de medicina regenerativa
Impacte de l'entorn hemodinàmic a la funcionalitat de les cèl·lules vasculars
Administració controlada de fàrmacs en dispositius vasculars